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全自動(dòng)生化分析儀時(shí)，儀器的交叉污染現(xiàn)象是引起實(shí)驗(yàn)結(jié)果偏離的一個(gè)原因。由于全自動(dòng)生化分析儀試劑針需要解除各種試劑，一般難以清洗干凈，所以容易造成分析項(xiàng)目的攜帶污染。而生化項(xiàng)目的測定往往需要僅幾微升樣本，試劑往往需要幾百微升 ，尤其在沒有自動(dòng)清洗程序的流動(dòng)池式生化分析儀上，由于前帶現(xiàn)象的存在，如果前一個(gè)人標(biāo)本為高值樣本，則接后的個(gè)低值標(biāo)本結(jié)果應(yīng)慎重報(bào)告。

就是具有自動(dòng)清洗程序的全自動(dòng)生化分析儀也有交叉污染，例如Beckman 全自動(dòng)生化分析儀CX4，它的試劑針(probe)、樣品吸樣針及反應(yīng)攪拌棒是利用高壓沖洗洗液沖洗，然后用高壓壓縮空氣吹干，有時(shí)由于洗液壓力和壓縮空氣壓力偏低，使試劑吸針、樣品針及反應(yīng)攪拌棒沖洗不干凈、吹不干，從而導(dǎo)致反應(yīng)池之間相互污染、試劑間交叉污染，是檢驗(yàn)結(jié)果偏離。另一個(gè)值得注意的問題是許多生化儀器由于長期頻繁的利用，使加樣針和試劑針的磨損加重或的“特氟龍”吸頭不及時(shí)更換，使吸樣針或試劑針密封層增大，產(chǎn)生泄露現(xiàn)象也是造成樣本間及實(shí)際間項(xiàng)目污染的一個(gè)重要原因。

在全自動(dòng)生化分析儀使用中，我們發(fā)現(xiàn)一個(gè)項(xiàng)目會(huì)影響緊隨其后項(xiàng)目的測試結(jié)果，造成這種影響的原因之一是一種實(shí)際中含有另一試驗(yàn)的測定物質(zhì)而直接干擾其測試結(jié)果。比如：在TP試劑中含有大量的CUSO4,如果將Cu放在TP項(xiàng)目的后面檢測，會(huì)使檢測結(jié)果偏高或重復(fù)性差。再如P放在含有磷酸鹽的項(xiàng)目后面，TBA放在含有膽酸鹽的項(xiàng)目后面都會(huì)使檢測結(jié)果偏高或重復(fù)性差。

近20年來生化分析發(fā)展快速。光譜技術(shù)已從單一的比色法發(fā)展為分光光度法、透射比濁法、原子吸收和火焰發(fā)射光譜法、分子熒光光譜法。分離技術(shù)除了一般的離心和超離心技術(shù)外，在層析和電泳技術(shù)方面有更廣泛的發(fā)展和應(yīng)用。層析技術(shù)如薄層層析、凝膠層析、離心交換層析、親和層析、氣相層析、液相色譜（HPLC）等應(yīng)用也越來越廣泛，特別是HPLC以其快速、高分辨率在微量代謝物、檢測方面更勝一籌。