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分析是現代生物分析技術中重要的一種方法，利用它可對蛋白質、抗原、及細胞進行定量分析。例如在檢測中，經常用一些具有特殊物理化學性質的標記物如性同位素、酶、膠體金和有機熒光染料分子等對（或抗原）進行偶聯標記，在抗原、識別后，通過對標記物的定性或定量檢測而達到對抗原（或）檢測的目的。由于磁性納米粒子具有超順磁性，為樣品的分離、富集和提純提供了很大方便，在檢測方面受到廣泛關注。

磁性納米粒子在體內診斷方面的應用主要用于成像。由于成像在診斷上的發展，出現了一類新型-磁性。這些給服用后的主要用途是提高正常和患病組織的對比度（造影劑）和/或顯示功能或血流情況。超順磁氧化鐵納米粒子在體外和體內細胞和分子成像中成為一類新的探針。在中使用超順磁顯影劑具有產生比順磁的顯影劑更強的質子弛豫的優點。因而，需要注射到體內的顯影劑劑量更少。然而，不便于進行原位監測。

洗脫不充分有時候我們裂解結合液各種條件優化到了了，可是核酸得率仍然很低。這種情況有可能是磁珠結合了核酸，但是由于洗脫不充分，磁珠結合的核酸沒有被洗脫下來。首先，磁珠在晾干過程中可能干燥過度，導致核酸干結在磁珠上不能洗脫下來；第二，洗脫液體積過小導致無法充分洗脫。晾干過程中，需要觀察磁珠處于稍微濕潤的狀態即可，不能完全干燥，這樣核酸更容易溶解于洗脫液中。洗脫體積不能太少也不能太多，太少磁珠上的核酸很難洗脫充分，太多會導致濃度偏低。一般來說 0.5mg 的磁珠，洗脫液的體積為 70-100ul。

核酸的高電荷磷酸骨架使其比蛋白質、多糖、脂肪等其他生物大分子更具親水性，所以利用核酸的這一性質結合親水性極強的硅羥基磁珠，可實現核酸與其他生物大分子的分離。硅羥基磁珠吸附核酸的原理，一般認為利用緩沖液中帶正電的鈉離子在帶負電的核酸和帶負電磁性微球間充當電橋作用，使得核酸磷酸骨架與磁性微球通過靜電作用和氫鍵作用相互吸附，從而可實現核酸的結合。但由于硅羥基表面的極強的親水性，所以在吸附核酸的同時也能少量吸附其他的親水性物質，所以必須配制相應的洗滌液去洗去核酸以外的雜質。