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目前，大多數土壤酸化嚴重或營養豐富，或者遭受連作疾病和有害細菌的侵害，這使得普通微生物制劑難以進入土壤。盡管提前施用有機肥會好得多，但外部環境很難改變。因此，我們可以應用包裹有養分且具有多種微生物菌劑功能的自給式營養生物菌對土壤進行沖洗和施肥，使施用到土壤后也存在適合微生物種群繁殖的營養小環境，使微生物菌劑能夠快速繁殖并逐漸改變周圍的土壤環境。此外，有害細菌可以自行消除，有益細菌的含量可以增加，效果會越好。一般來說，這種微生物菌劑推薦使用2-3次。只有這樣才能有效地改善土壤環境。

生物菌肥的優勢:1 .土壤改良(1)通過有益菌的大量繁殖，大量有益菌在植物根部周圍形成優勢種群，抑制其他有害菌的生活活動。(2)土壤有機質快速分解，促進土壤團聚體的形成，通過有益菌的活動使土壤疏松，土壤的保肥、供肥、保水、供水和透氣性得到良好調節。(3)分解土壤中的農殘，避免下一季度殘留對農作物的傷害。它還分解植物生長過程中從根部排出的有害物質。2.固氮、解磷、解鉀功能可以部分利用空氣中的氮，通過有益菌的生長和代謝產生相應的酶和酸，分解土壤中不溶性磷鉀肥(95%的不溶性磷肥和98%的不溶性鉀肥)，從而成為植物可以吸收的磷鉀肥。因此，可以大大提高作物對肥料的利用率，從而減少肥料的使用。

主要功能(1)提高肥料利用率:一些微生物細菌能分解土壤中固定的磷、鉀元素，釋放出來供作物吸收利用，吸收利用空氣中的氮，合成“生態氮肥”。(2)土壤改良:在土壤中施用微生物肥料后，不僅補充了大量有機質，增加了土壤的土內結構，而且使微生物細菌在土壤中快速繁殖，形成生命力強的益生菌群，從根本上改善了土壤和根系周圍的生態結構，使化肥硬化的土壤多年來疏松透氣。(3)預防志病:微生物的有益微生物在土壤中快速繁殖，在作物根際土壤微生態系統中形成優勢種群，防止或抑制其他有害細菌的生長繁殖和對作物的危害

微生物肥料的含義:微生物肥料是指一種含有活微生物的生物制劑，在使用中可以獲得特定的肥效，可以增加植物產量或提。微生物肥料對我國農業發展的意義由于化肥的長期不合理使用，農業生產中出現了一系列問題。除了我國高復種指數和耕地連作生產外，土壤連續生產能力和肥料利用率下降，土壤質量和農產品質量安全問題日益嚴重。為了解決這些問題，微生物肥料是的。微生物肥料對農業發展的意義在于:，“微生物肥料的前景非常廣闊”，利用合理的微生物種群將肥料用量減少20-30%左右。