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微生物肥料（菌肥）的主要功效是促進植物根系的發育。有的有機肥料則以供應農作物所需養分為主，如人糞尿、雞糞等等，這種差別主要視不同有機肥料中有機質和含氮量之間的比例而定。只要我們能知道植物根系的重要性，就能知道微生物有機肥內含的多種功能性微生物進入土壤后，在生長繁殖過程中產生大量的次生代謝產物，這些產物能夠促進土壤團粒結構的形成。團粒結構的形成能使土壤變得疏松、綿軟，保水保肥性能增強，水、氣、熱更加協調，減少土壤板結，有利于保水、保肥、通氣和促進根系發展，為農作物提供舒適的生長環境

氮肥的識別碳酸氫銨： 面的一般問題不大，質量都過關；市場上現在還有顆粒的，幾乎沒有真的，因為氮肥在要成顆粒時要求的含量46，也就是尿素了。有點真的也是用面子壓的，他的味道很容易識別，還有抓在手里看下，捻一捻，有“油濕”感、表面光滑的一般應是真的，干燥、表面粗糙的多為假劣肥料。人尿含水分和尿素、鹽、尿酸、馬尿酸、磷酸鹽、銨鹽、微量元素及生長素等。尿 素： 很少有假的，尿素是一個傳統的肥料，使用的人也是很多的，都有自己獨特的識別方法，很常用的就是在手里抓抓，看看他的溶解速度。

可以說，正是有機肥的廣泛使用，才能使得我們的農業逐步的開始向無公害農業轉變，才能使得讓更多的有機食品、水果、蔬菜走向我們的餐桌。隨著經濟的發展和城鎮化進程的加快，城市人口激增，城市的污染物也在不斷增加。據國家的預測20世紀末，中國有機肥中氮磷鉀養分總量達1971～2087±91。其實，城市污染物通過處理可以變成有機肥。有機肥為有機農業、生態農業所必須，它能改善土壤性質，提高土壤肥力，提高農產品的產量和質量，還能遏制環境污染。建議政府加大投入，在城鎮建設的規劃中，設計好城市污染物的分類處理，并將此作為一個新型產業，將城市污染物處理成價格低廉、運輸方便的有機肥，變廢為寶為農業服務

廄肥的作用：①提供植物養分。包括必需的大量元素氮、磷、鉀、鈣、鎂、硫和微量元素鐵、錳、硼、鋅、鉬、銅等無機養分；氨基酸、酰胺、核酸等有機養分和活性物質如維生素B1、B6等。保持養分的相對平衡。②提高土壤養分的有效性。廄肥中含大量微生物及各種酶（蛋白酶、脲酶、磷酸化酶），促使有機態氮、磷變為無機態，供作物吸收。并能使土壤中鈣、鎂、鐵、鋁等形成穩定絡合物，減少對磷的固定，提高有效磷含量。穩定化處理是指通過生物降解已將物料中易被微生物降解的有機成分，如可溶性有機物、淀粉、蛋白質等轉化為相對穩定的有機物，不會對植物種子和作物苗期生長產生不利的影響。③改良土壤結構。腐殖質膠體促進土壤團粒結構形成，降低容重，提高土壤的通透性，協調水、氣矛盾。還能提高土壤的緩沖性和改良礦毒田。④培肥地力，提高土壤的保肥、保水力。廄肥腐熟后主要作基肥用。新鮮廄肥的養分多為有機態，碳氮比（C/N）值大，不宜直接施用，尤其不能直接施入水稻田。