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凝結芽孢桿在腸道內的分泌乳酸，營造酸性環境，適合有益菌生長，調養腸道菌群的平衡；還能分泌淀粉酶和蛋白酶等酶類，促進機體對營養物質的消化和吸收；可產生B族維生素、氨基酸和短鏈脂肪酸等物質，補充動物自身所需的某些營養物質，并能加快腸道蠕動速度，改善腸道功能。凝結芽孢桿在腸道內定居后，可產生大量凝固素和L一乳酸等抑制有害菌物質，對大腸埃希氏菌、沙門菌、志賀氏菌、變形桿、長球菌、明串珠球菌、李斯特菌和小球菌等都有抑制作用，促進動物健康生長。

發酵飼料的生產整個流程是：菌的擴繁、菌與底物原料的混合、厭氧包裝、成品出庫。這其中牽扯到的必備的設備有菌擴繁罐、混合機、熱封口機，這三種是缺一不可的。首先一個菌擴繁罐對一般的小型客戶而言尤其是養殖戶自己生產用的情況下，可有可無，因為也可以直接購買成品的菌生產，但是對于飼料廠必須得上這個設備，可以降低一部分的成本。菌擴繁罐，簡單的說就是把原始菌進行擴繁，有由原來的十公斤擴繁成500公斤。

生產中常用的益生菌分為三類：一類是乳酸菌。它是指以乳酸為主要產物的革蘭氏陽性菌。按其代謝模式可分為雙歧、同型發酵乳酸菌、兼性異型發酵乳酸菌以及專性異型發酵乳酸菌。應用類型有乳酸雙歧、干酪乳、發酵乳、植物乳、羅伊氏乳。第二類是芽孢。芽孢是革蘭氏陽性菌，能形成孢子，是傳統發酵豆制品的重要菌株，能分泌多種水解酶，包括多糖酶、蛋白酶及核酸酶,能有效利用非淀粉多糖和寡糖,有效降解大豆等飼料原料中的抗營養因子。生產中應用的主要為枯草芽孢和地衣芽孢。第三類為酵母菌。酵母菌屬兼性好氧菌，在好氧條件下進行好氧呼吸能將有機物完全氧化成二氧化碳、水，而在缺氧條件下將糖發酵成乙醇。酵母菌可產生氧化還原酶、脂肪酶蛋白酶、內源糖苷酶、木聚糖酶、內源葡聚糖酶、脫氫酶、脫羧酶、磷酸酶等。

影響微生物發酵飼料使用效果的因素

微生物發酵飼料是活菌制劑，各種不良因素均能使其活性降低，甚至喪失作用。使用微生物發酵飼料的關鍵是保證這些微生物被混入飼料后，能保持活性，直至被采食進入動物腸道，并在腸道相應的部位定位繁殖。在飼料加工、貯存過程中，諸多因素都會對活性保持有不利影響，影響程度視微生物種類及形式不同而異。