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              發布時間:2020-12-25 03:21  

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                全轉錄組測序    

              全轉錄組是指特定組織或細胞在特定狀態下所有轉錄產物的總和,包括mRNA和各種noncoding RNA。我們知道生物體本身的轉錄過程是一個動態變化且十分復雜的分子作用網絡,如果只是對某個單一RNA分子的研究,有時并不能準確的發現分子作用機制。而競爭性內源RNA(ceRNA)理論闡述了一種全新的轉錄調控模式:ceRNA(包括lncRNA、circRNA、mRNA、假基因等)分子能夠通過miRNA應答元件(microRNA Respe Element, MRE)競爭性地結合相同的miRNA來調節彼此的表達水平。舉個例子:miRNA會導致基因沉默現象發生,而如果lncRNA競爭性結合了miRNA,從而影響了miRNA基因沉默功能實現。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下,其基因表達情況是不相同的。

                    ceRNA是目前轉錄調控領域的熱點內容之一,通過全轉錄組研究能夠系統性的闡述ceRNA的分子作用機制。目前對全轉錄組簡便的方法就是構建2個測序文庫分別進行測序。標準的生物信息學分析能夠得到mRNA、lncRNA、circRNA、miRNA各自的研究內容,靶向調控網絡、ceRNA網絡、共表達網絡分析可以將這幾種RNA聯合起來分析,從而發現新的調控網絡模型。去除rRNA的鏈特異性文庫,含有的RNA信息含量十分豐富,通過測序和生物信息學分析能夠得到mRNA、lncRNA、circRNA的鑒定及注釋信息。置于玻璃勻漿器中,加入1ml的細胞裂解緩沖液勻漿至不見組織塊,轉入1。不過該文庫構建時會進行片段化選擇從而濾掉了small RNA的信息,所以需要另外再構建一個small RNA文庫,進行測序分析后可以得到miRNA和其他small RNA的鑒定及注釋信息。全轉錄組測序方案路線圖如下所示:





              凝膠阻滯遷移電泳檢測服務(EMSA)


              凝膠遷移或電泳遷移率實驗(electrophoretic mobility shift assay,EMSA)是一種研究DNA/RNA結合蛋白和其相關的DNA/RNA結合序列相互作用的技術,可用于定性和定量分析。依據實驗需要,設計標記探針、非標記探針、蛋白特異性抗ti等參照物,基于DNA-蛋白質或RNA-蛋白質復合體在聚bing烯酰胺凝膠電泳(PAGE)中有不同遷移率的原理,當轉錄因子與特異的DNA或RNA結合后,其在PAGE中的遷移率將小于未結合核蛋白轉錄因子的DNA,從而檢測到活化的與DNA或RNA結合的蛋白轉錄或調節因子。ELISA是一種結合抗原、抗ti特異性反應和酶對底物高xiao催化作用的高敏感性免yi學實驗技術。







              分子生物學檢測服務

              隨著生命科學和化學的不斷發展,人們對生物體的認知已經逐漸深入到微觀水平。從單個的生物體到qi官到組織到細胞,再從細胞結構到核酸和蛋白的分子水平,人們意識到可以通過檢測分子水平的線性結構(如核酸序列),來橫向比較不同物種,同物種不同個體,同個體不同細胞或不同生理(病理)狀態的差異。這就為生物學和醫學的各個領域提供了技術平臺。分子生物學檢測技術是現代分子生物學與分子遺傳學取得進步的結晶,是在人們對基因的結構以及基因的表達和調控等生命本質問題的認識日益加深的基礎上產生的。離心后吸上清液400u1移入相應編號的EP管中,再加入400ul異充分混勻。近年來,分子生物學檢測技術的方法學研究取得了進展,先后建立了各種分子生物學檢測技術。








              高l效液相色譜法檢驗方法


              高l效液相色譜法是一種現代液體色譜法,其基本方法是將具一定極性的單一溶劑或不同比例的混合溶液作為流動相,用高壓輸液泵將流動相注入裝有填充劑的色譜柱,注入的供試品被流動相帶入柱內進行分離后,各成分先后進入檢測器,用記錄儀或數據處理裝置記錄色譜圖或進行數據處理,得到測定結果。由于應用各種性質的微粒填料和加壓的液體流動相,本法具有分離性能高,分析速度快的特點。腺病毒是一種無包膜的球型結構的病毒,遺傳物質為線型雙股DNA形式。


              高l效液相色譜法適用于能在特定填充劑的色譜柱上進行分離的藥品的分析測定,特別是多組分藥品的測定、雜質檢查和大分子物質的測定。有的藥品需要在色譜分離前或后經過衍生化反.應,方能進行分離或檢測。常用的色譜柱填充劑有硅膠用于正相色譜;化學鍵合固定相,根據鍵合的基團不同可用于反相或正相色譜,其中常用的是十八烷基硅l烷(又稱ODS)鍵合硅膠,可用于反相色譜或離子對色譜離子交換填料,用于離子交換色譜,是有一定孔徑的大孔填料,用于排阻色譜。在65℃恒溫水浴鍋中水浴30min,也可轉入37℃水浴12~24h,間歇振蕩離心管數次。











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