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生物有機肥的概念生物有機肥是有益微生物與有機肥結合形成新型、、安全的微生物有機肥料。通過高溫烘干的有機肥不能屬于生物有機肥，因為它沒有大量的有益微生物。不同廠家生產的有機肥差異很大，有的采用自然微生物進行發酵；有的在堆制發酵時采用了特殊的發酵設備和通風設備；有的通過加入發酵菌劑、微生物除臭劑來達到加快發酵的目的；有的則加入一定量的功能菌來提高生物有機肥的肥效。

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生物有機肥富含有益微生物菌群一般生物肥都含有酵母菌、乳酸菌、纖維素分解菌等有益微生物，而加有功能菌的生物有機肥還可能含有固氮菌、鉀細菌、磷細菌、光合細菌及假單胞菌等一些根際促生菌（PGPR）。這些菌除了具有產生大量活性物質的能力外，有的還具有固氮、解磷、解鉀的能力，有的具有抑制植物根際病原菌的能力，有的則具有改善土壤微生態環境的能力。

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生物有機肥含有許多有機酸、腐植質酸及其他羥基類物質，它們都具有很強的螯合能力，能與許多金屬元素螯合形成螯合物，可防止土壤對這些營養元素的固定而失效。比如，生物有機肥與磷肥摻合施用，其中的有機酸等螯合物能將土壤中活性很強的鋁離子螯合，可防止鋁與磷結合形成作物很難吸收的閉蓄態磷，大大提高土壤有效態磷含量。