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不同的傳播機制引起的傳1染病，消毒的效果有所不同。腸胃道傳1染病，病原體隨排泄物或嘔吐物排出體外，污染范圍較為局限，如能及時正常地進行消毒，切斷傳播途徑，中斷傳播的效果較好。呼吸道傳1染病，病原體隨呼吸、咳嗽、噴嚏而排出，再通過飛沫和塵埃而播散，污染范圍不確切，進行消毒較為困難。須同時采取空間隔離，才能中斷傳1染。蟲媒傳1染病則采取殺蟲滅鼠等方法。

不同傳1染病病原體各有特點，對不同消毒方法的耐受性不同。如細菌芽胞對各種消毒措施的耐受力強，必須用殺菌力強的滅菌劑、熱力或輻射處理，才能取得較好效果。故一般將其作為難消毒的代表。其他如結1核桿1菌對熱力消毒敏感，而對一般消毒劑的耐受力卻比其他細菌為強。真菌孢子對紫外線抵抗力很強，但較易被電離輻射所殺滅。腸道病毒對過氧乙1酸的耐受力與細菌繁殖體相近，但季胺鹽類對之無效。肉毒桿1菌素易為堿破壞，但對酸耐受力強。至于其他細菌繁殖體和病毒、螺旋體、支原體、衣原體、立克次體對一般消毒處理耐受力均差。常見消毒方法一般均能取得較好效果。

不同病種的消毒，應注意區別對待。病毒性肝1炎患者，應用較強含氯消毒劑或氯人劑消毒，不宜應用季胺鹽及來蘇等一般消毒劑處理。在消毒工作時還須注意影響消毒的因素，如消毒劑量（包括消毒的強度及作用時間），消毒物品污染的程度，消毒的溫度，濕度及酸堿度，有關化學拮抗物，消毒劑的穿透力及表面張力等。

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輻射消毒有非電離輻射與電離輻射二種。前者有紫外線，紅外線和微波，后者包括丙種射線的高能電子束（陰極射線）。紅外線和微波主要依靠產熱殺菌。電離輻射設備昂貴，對物品及人體有一定傷害，故使用較少。應用多為紫外線，可引起細胞成份、特別是核酸、原漿蛋白和酸發生變化，導致微生物死1亡。紫外線波長范圍2100～3280A，殺滅微生物的波長為2000～3000A，以2500～2650A作用強。對紫外線耐受力以真菌孢子強，細菌芽胞次之，細菌繁殖體弱，僅少數例外。紫外線穿透力差，3000A以下者不能透過2mm厚的普通玻璃。空氣中塵埃及相對濕度可降低其殺菌效果。對水的穿透力隨深度和濁度而降低。但因使用方便，對藥品無損傷，故廣泛用于空氣及一般物品表面消毒。照射人體能發生皮膚紅斑，紫外線眼炎和臭氧中1毒等。故使用時人應避開或用相應的保護措施。日光曝曬亦依靠其中的紫外線，但由于大氣層中的散射和吸收使用，僅39%可達地面，故僅適用于耐力低的微生物，且須較長時間曝曬。此外過濾除1菌除實驗室應用外，僅換氣的建筑中，可采用空氣過濾，故一般消毒工作難以應用。