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發(fā)布時間:2021-05-20 06:32  
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PCR法不僅僅局限于分子生物學,還因其簡便、迅速等特點被廣泛應用于醫(yī)學、法醫(yī)學、食品、環(huán)境衛(wèi)生檢驗、動植物檢驗等其它領域。Taq DNA聚合酶是PCR法普遍使用的聚合酶,但其具有如下局限性。
1. 可信度 (Fidelity):通常Taq DNA Polymerase的Fidelity并不高,PCR反應有時會出現(xiàn)錯配 (Misincorporation) 現(xiàn)象,因而PCR克1隆、變異導入等實驗中,需加以注意。
2. 擴增的DNA長度:使用Taq DNA Polymerase進行PCR擴增時,通常可擴增幾kb的DNA,超過10 kb則比較困難。這就給利用PCR進行Mapping等Genome解析帶來麻煩。
3. 擴增量:使用Taq DNA Polymerase進行PCR產物克1隆及食品、環(huán)境衛(wèi)生檢驗等時,擴增量常常達不到要求。為解決以上難題,Takara在對Polymerase、Buffer及反應條件等進行深入研究的基礎上,開發(fā)了LA PCR (Long and Accurate PCR) 技術,運用此技術可大量正確地擴增長達40 kb 的DNA部分片段。LA PCR技術擴展了PCR的應用范圍,可在Genome解析、基因診斷、長片段 DNA的克1隆及變異導入等方面發(fā)揮優(yōu)勢。
LA PCR的原理
LA PCR的關鍵是具有3′→5′Exonuclease活性 (Proof reading活性) 的耐熱性DNA聚合酶。在PCR過程中當有錯誤的堿基攝入時,反應性能將大幅度下降,TaKaRa Ex Taq 和TaKaRa LA Taq 依靠3′→5′Exonuclease活性可將錯配的堿基除去,從而延伸反應能順利地進行下去,使長鏈DNA的擴增成為可能。
出現(xiàn)的PCR擴增條帶與目的靶序列條帶一致,有時其條帶更整齊,亮度更高。
引物設計不合適:選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性,因而在進行PCR擴增時,擴增出的PCR產物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現(xiàn)假陽性。需重新設計引物。
靶序列或擴增產物的交叉污染:這種污染有兩種原因:一是整個基因組或大片段的交叉污染,導致假陽性。這種假陽性可用以下方法解決:操作時應小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣槍內或濺出離心管外。除酶及不能耐高溫的物質外,所有試劑或器材均應高壓消毒。所用離心管及樣進槍頭等均應一次性使用。必要時,在加標本前,反應管和試劑用紫外線照射,以破壞存在的核酸。二是空氣中的小片段核酸污染,這些小片段比靶序列短,但有一定的同源性。可互相拼接,與引物互補后,可擴增出PCR產物,而導致假陽性的產生,可用巢式PCR方法來減輕或消除。
復合PCR(multiplex PCR)技術
在同一反應中用多組引物同時擴增幾種基因片段.如果基因的某一區(qū)段有缺失則相應的電泳譜上這一區(qū)帶就會消失。復合PCR主要用于同一病原體的分型及同時檢測多種病原體、多個點突變的分子病的診斷。
重組PCR技術
重組PCR技術是在兩個PCR擴增體系中,兩對引物分別由其中之一在其5°-端和3-端引物上帶.上一段互補的序列混合兩種PCR擴增產物.經變性和復性。兩組PCR產物互補序列發(fā)生粘連。其中一條重組雜合鏈能在PCR條件下發(fā)生聚合延伸反應,產生一個包含兩個不同基因的雜合基因。