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土壤結構由礦物質、有機物和微生物組成，是作物生長發育的基礎。土壤中的有益微生物直接參與一系列土壤肥力的形成和發展過程，如土壤中物質和能量的轉化、腐殖質的形成和分解、養分的釋放、氮的固定等。通過人工手段增加土壤中有益微生物的數量可以增強土壤中微生物的活性，從而提高土壤的肥力。尤其是作物根際土壤微生態系統的微生物活性對植物根系營養更為重要。因此，在植物根際施用微生物肥料可以增加根際土壤中有益細菌的數量和活性，從而提高土壤肥力。

(1)在溫度上使用菌肥時，一般要求土壤溫度控制在5~35℃范圍內。如果溫度低于5℃，鈞種不能發酵繁殖。如果溫度高于35℃，駿種可能會被燒死。如果溫度超過兩個土壤溫度限值，菌肥的施用效果將相對較差。(2)土壤含水量一般適合50-70%的濕度。像那種固氮菌肥一樣，適當的土壤濕度應該保持在60%左右，也就是說，干濕交替的土壤濕度適宜。此外，還應注意:用水沖洗時，應盡可能選用可施用的菌肥，且細菌不應長時間浸沒，以免影響細菌的活性。4.不合理的混合現在許多人將菌肥與其他肥料混合以節省麻煩，但是如果混合不當，會在一定程度上影響細菌的活性。例如，菌肥與殺菌劑、殺蟲劑、除草劑等混合。菌肥與過酸或過酸肥料配合使用，菌肥與高濃度化肥混合或菌肥與化肥混合吸收水分，影響細菌活性等。這些不合理的混合物會影響細菌的存活，從而影響使用效果。

該復合菌劑主要具有以下功能。該復合菌一季使用兩次，以強化整個微生物種群，強化有益群，可快速補充土壤中的有益菌，使有益菌繁殖成優勢菌群。有益菌通過競爭、和溶菌功能控制有害微生物的存活。抑制疾病在土壤中的傳播，減少農業瑤族復合微生物細菌產生的代謝物數量，有利于根系的生長和擴展。有益菌分泌的素和各種活性酶能有效抑制或殺滅病原菌，從而減少土傳疾病的發生，減少農用藥肥的使用。拯救“固定”營養復合微生物菌可以實現固氮，從土壤中的氮中形成腐植酸銨，將土壤中固化的磷和鉀釋放為有效鉀和有效磷。復合微生物菌的代謝產物也能改善土壤團聚體結構，增加土壤保水保肥能力。