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控制潔凈室的人數盡管在進入潔凈室前必須更衣，但人在潔凈室的行走和操作還是有一定的產塵量，這些塵埃需要潔凈室的下送氣流帶走。當產塵量超過了室內氣流的凈化能力，潔凈度就會急速下降。當這些超量的人(或物)退出潔凈室，再通過空調凈化系統的自凈能力，潔凈度又會恢復到正常。GMP規定潔凈室內空氣的微生物粒和塵粒數應定期監測，監測的結果記錄存檔。在生產過程中，這些數據在短時間內相差很遠，則表明潔凈室內人(或物)已經超過潔凈室的大承受量。

物料凈化措施物料在進入潔凈室前必須有效地消除外表面沾染的微粒和微生物。為此，物料凈化用室應包括清理室、氣閘室或傳遞窗。物料在外包裝清理室拆除外包裝，裝入潔凈容器內備用。此外，還應經氣閘室或傳遞窗方可進入潔凈室，送人滅菌室的物料則應滅菌。傳遞窗室用來在室內外或不同潔凈級別的潔凈室之間傳遞物品時，為防止破壞潔凈度暫時起隔斷氣流貫穿的裝置。傳遞物料的傳遞帶不得從潔凈級別低的輸送到潔凈級別高的區域，一般只能在傳遞窗兩邊分段傳送。

物料通道物料的凈化路徑和人的凈化路徑是分開獨立設置的，物料的人口和流動方向也必須與分開，盡量做到不交叉往返，避免物流通過正在操作的區域。大型的綜合生產廠房，可以考慮設置多個物料人口，但彼此之間不得相互影響。生產操作區不得作為物料傳遞的通道，生產場所的空間應盡量減少開門，以保證操作室的氣密性和潔凈度。