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發布時間:2021-05-21 09:19  
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原位雜交試驗
收集斑馬魚的胚胎,在Holfretor水中培養,到達所需要的發育時期時,用蛋白酶去除卵膜,用4%多聚甲醛固定,在4℃保存,二十四小時后用50%甲6醇2%多聚甲醛溶液洗,然后換成甲9醇,在-20C 保存,待用(兩天和兩天以上的胚胎需要用雙氧6水處理,去除色素。或者使用苯锍脲稀溶液培養,可阻斷色素的形成)
就DNA探針和RNA探針的比較,DNA探針在雜交過程中會出現探針雙鏈之間退火的可能,也更傾向于在溶液中形成大分子的探針聚合體,從而影響其滲透能力。而RNA 探針的應用,將提高DNA-RNA雜交子的熱穩定性。
Tips:RNA探針因其單鏈、高分子結合力、可適應高溫雜交的特性,其檢測特異性和靈敏度均優于DNA探針。常用的RNA探針標記方法為構建質粒后進行轉率合成。通過PCR擴增的方法,可以更方便地進行RNA探針的制備;RNA探針合成后,還需驗證其對目標片段檢測的靈敏度和特異性。

雜交液中的陽離子濃度通過靜電排斥作用影響了雜交體之間的鏈穩定性,較高的鹽濃度將增加雜交體的穩定性。大于0.4M的Na離子濃度,對Tm值、雙鏈復性速率的影響不大,但隨著Na離子濃度的降低,將顯著影響Tm值和雙鏈復性速率。
有2機溶2劑(甲酰胺)的作用是降低DNA-DNA和DNA-RNA等雙鏈體的解鏈溫度。通常DNA需要在0.1~0.2M Na 90~100℃的條件下變性,那么應用于原位雜交,樣品必須在65~75℃的條件下進行長時間變性,這將導致樣品形態學的破壞。50%甲酰胺的應用能將雜交溫度降至30~45℃。
硫酸葡聚糖具有很強的水合性,高濃度的硫酸葡聚糖會使得核酸分子無法獲得周邊親水環境,增加了探針濃度,加快雜交反應速率。