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除氣采用流動相脫氣，可避免 HPLC系統的故障，從而順利地獲得理想的數據。HPLC系統中不希望有氣泡存在。HPLC泵在輸送液體時會產生很大的作用力，因為氣體的壓縮比比液體大得多，所以有氣泡出現時，你會看到瞬時流速降低，系統壓力降低。若此氣泡足夠大，液相泵將無法輸送任何溶劑，并且當壓力降到預定的壓力下限以下時，泵將停止工作。一些泵的設計很好的排除了氣泡，而有些泵的設計在有氣泡的情況下會停止工作。

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在輸液泵中，由于系統壓力較大，氣泡通常會在流動相溶液中溶解，并與液柱相通。但當進入檢測器流通池后，系統壓力又恢復到氣壓，因此氣泡可能再次出現在檢測器流通池中，在色譜柱上會出現不規律的毛刺。在 UV/VIS/UV/VIS)探測器的液相色譜圖中，噪音毛刺通常是氣泡進入和通過循環池的信號。另外，電化學(EC)檢測儀對流動相中的溶解氧的存在十分敏感，它是由被測物質在電極表面發生氧化還原反應引起電流變化的。另外，泡泡的存在有時會造成保留時間不重復。因此，必須注意消除流動相中的空氣，同時也要防止管道內的空氣(例如 PTFE管)向流動相滲透。

泵下一步要沖洗的是泵。在一次分析之后，不要在幾分鐘內停泵，尤其是在流動相中含有難揮發的緩沖液(例如磷酸鹽)。若不能連續使用，則在流動相蒸發時，難揮發物會粘附在活塞密封墊面上，產生難揮發物沉淀。它是造成泵密封墊磨損和單向閥泄漏的主要原因之一。因此，不論使用時間長短，在停泵之前都必須用無緩沖液流動相沖洗泵在半個小時以上，如果流動相中有難揮發的鹽類，那么建議沖洗時間要長一些。

自動進樣器自動化進樣器還應按規定進行清洗。目前設備多配備有自動進樣器的洗液瓶，通常只要注意及時更換，補充沖洗液。還應按照自動化進樣器中所用的洗滌液的流動處理，并根據溶劑的有效期和規定，清洗儲液瓶或更換洗滌液。目前自動取樣器的安裝、操作都很簡單，如果時間允許(尤其是在夜間運行)，每次分析后設純溶劑1、2針(如、)，也是一種好的做法。4、色譜柱在使用過程中，對柱子的污染增大。一般表現是：基線運行時，在已記錄的色譜中基線噪聲增加，泵壓力也增大。處理這一問題有效的方法是在每一批樣品分析完畢或準備卸下柱子時，清洗柱子(例如，、和水)。采用梯度沖洗效果較好，具體比例取決于柱體的使用說明及性能。

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起因：①在線過濾堵塞②泵頭下訂單向閥堵住③檢測池很臟，也有可能是光路有些堵，再不行可能是燈壽命到了④抹布臟了，需要更換。對策：①在線濾網卸下，置燒杯，加純化水煮沸5-10分鐘后，超一下一般就可以了，如果還堵的話就拿稀泡，還不行，就換新的，這是個消耗品②將泵頭下端向閥卸下，兩個都可能堵死，剛卸下來時豎在耳邊搖晃就聽不到聲音了。只需簡單地拿起洗耳球將單向閥吹一下(方向)，吹了沒反應可以拿溶劑超聲，但不可用水煮，一般超至在耳邊搖動聲音就不會影響到。③先用溶劑將檢測池沖洗一下，具體的試樣用什么試樣；若不沖洗，將檢測池卸下，看燈能量，若能量還可以(有個幾千)，可能得清洗光路。首先還是請工程師來清洗，因為要清理的零件在探測器下面有一個黑色的碎片，中間有一條縫，而且那一塊的螺絲都是八角的，卸起來很麻煩。

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④拿出5個樣品盤，可以看到里面有一個黑色凸起(看不清是用電筒)，平時進樣針就是從那個地方吸的。伸手就能卸下來，里面有一個小白圈(用多了自然就黑了)，換一個新的就好了，一般只有10個才能買儀器。在使用過程中，液相色譜有四個主要要素需要注意：1.液相色譜儀本身：通常儀器本身是沒有問題的，尤其是新買回來的儀器。就儀器本身而言，的是儀器的檢驗，新買回來的儀器一般都是由賣方先對儀器做系統的確認工作(包括 IQ、 PQ、 OQ)，確認順利通過后，再請國家或省級儀器檢定局的來校驗，檢定合格后再用，檢定合格后再用，除此之外，還可以放心使用，此外，還可為儀器的正常使用提供保障。

一些柱效值的測量與計算方法由于色譜峰是假設在運動相中、固定相中樣品濃度為正態分布而獲得的樣品譜帶分布，所以常將色譜峰型看作正態曲線來計算理論塔板數。所以柱效(以理論塔板數量 n為單位)的公式習慣上定義為：在式中 tR為色譜峰的保留時間；σ2表示測定色譜峰與時間的偏差； a是與峰高(從測峰寬的基線量起)有關的常數，而ω b是用時間表示由色譜峰頂點與色譜峰的基線相交點的切線相交的距離。

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假設某一色譜峰為正態峰型，則每一種方法均能得到相同的結果。即便是獲得較為理想的峰型及溶質，由于柱內有溝槽或空隙，也會產生非正態峰型。因此不同的計算方法所得到的 n值相差較大。對于正常模式的偏離，通常用“前延”或“后延”表示。對這些峰型，測峰高度越高，計算出的理論塔板數值越大(精度越低)。很多情況下，色譜分析人員需要能夠反映整個峰型(包括拖尾)的柱效值，同時為了保證定量的重復性，還需要有很好的色譜峰對稱。此時色譜峰不對稱的計算方法是合適的。僅為了監測色譜柱從次使用到壽命結束過程中的柱效，那么上述任何一種都可以，應選擇簡單的方法。