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在蘋果、柑橘、葡萄、梨、草莓、李子和獼猴桃等多個(gè)樹種上的研究結(jié)果表明，生物有機(jī)肥明顯提高了果品品質(zhì)。內(nèi)在品質(zhì)上主要提高了果實(shí)的可溶性固形物和含糖量、糖酸比和香氣品質(zhì)；從外在品質(zhì)看，提高了果實(shí)著色度和硬度，果形大小較勻稱。在設(shè)施栽培桃上的研究結(jié)果表明，施用生物有機(jī)肥比對照施用雞糞明顯改善了桃子品質(zhì)，可溶性糖含量增加1.0%，可滴定酸含量降低3.5%；施用生物有機(jī)肥的紅地球葡萄果實(shí)糖度達(dá)到14.39；顯著改善了富士蘋果果實(shí)的香氣品質(zhì)，揮發(fā)性物質(zhì)多13個(gè)成分，含量多5.7個(gè)百分點(diǎn)。

果園施用生物有機(jī)肥后顯著提高了果實(shí)可溶性固形物，蘋果由14.1%提高到15.6%，李子由10.6%提高到12.2%，桃由10.1%提高到11.3%，葡萄由15.1%提高到16.6%；蘋果的硬度由8.1提高到8.9，桃的硬度由9.1提高到11.1；蘋果糖酸比由19.6提高到28.2，葡萄糖酸比由17.8提高到26.1。在桃樹上噴施生物有機(jī)肥后，果實(shí)可溶性固形物提高了5.7-10.9%，果實(shí)風(fēng)味和品質(zhì)有所改善。

作物施用生物有機(jī)肥后， 其中的發(fā)酵菌和功能菌大量繁殖， 對改良土壤、促進(jìn)作物生長、減輕作物病害具有顯著效果。主要原因在于：一、肥料中的有益微生物會在土壤中大量定殖形成優(yōu)勢種群， 抑制其他有害微生物的生長繁殖，甚至對部分病原微生物產(chǎn)生拮抗作用，以減少其侵染作物根際的機(jī)會。

二、功能菌發(fā)揮功效增進(jìn)土壤肥力，比如施用含固氮微生物的肥料，可以增加土壤中的氮素來源；施用含解磷、解鉀微生物的肥料，其中的微生物可以將土壤中難溶的磷、鉀分解出來，以便作物吸收利用。

三、肥料中的許多微生物菌在生長繁殖過程中會產(chǎn)生對作物有益的代謝產(chǎn)物，能夠刺激作物生長，增強(qiáng)作物的抗病抗逆能力。